Le fédéralisme a continué de faire l'objet de soucis dans divers milieux. La Fondation pour la collaboration confédérale, après un an de travail, a pu dresser un premier bilan où l'enthousiasme est peu visible: certains cantons se refusent encore à coopérer notamment en ce qui concerne l'élimination de doubles-emplois coûteux, la communication d'expertises sur des sujets d'intérêt commun [33]. Plusieurs observateurs ont .stigmatisé les réflexes de souveraineté mal placés qui ont encore cours, ainsi que l'impuissance des cantons à se défendre contre les tendances centralisatrices des associations économiques [34]. Il arrive aussi que la souveraineté cantonale soit délibérément méprisée par le pouvoir central, comme le sort fait à certaines initiatives cantonales, de rang constitutionnel, en témoigne [35]. Le programme de la Fondation offre cependant des perspectives intéressantes sur divers plans; il faut mentionner notamment les travaux entrepris en vue de préparer une harmonisation fiscale [36]. Par ailleurs, 1968 a vu des réalisations importantes se produire, par la conclusion du concordat sur la PMI [37] et la collaboration en vue d'assurer le succès de l'amnistie fiscale [38]. En outre, onze cantons du centre et du nord-ouest se sont unis pour construire un institut d'éducation au travail dans le canton de Bâle-Campagne [39]. Le « fédéralisme horizontal », en multipliant les contacts intercantonaux, souffre cependant de défauts: les conférences réunissent les membres des gouvernements, qui sont surchargés, alors que les administrations restent souvent sans contacts. Pour remédier à cela, les cantons romands ont nommé un fonctionnaire chargé de la coordination en matière d'instruction publique; sur le plan suisse, la conférence des directeurs de l'Instruction publique s'est donné un comité permanent et un secrétariat [40].

La procédure de réunification des deux Bâles est loin d'être achevée. Certes, la Constituante élue en 1960 a terminé ses travaux le 6 septembre 1968. Mais des divergences sont apparues quant au mode de la consultation populaire prévue pour février 1969. L'opposition, assez considérable, qui s'est manifestée à Bâle-Campagne, refusait de voter séparément sur la constitution et sur les principes directeurs de la législation. Un recours en droit public, lancé contre les décisions de la Constituante et des gouvernements, a abouti, et la Constituante devra reprendre ses délibérations [41].